От Столетней войны до 1780 года
Столетняя война, ведущая к разрушению страны, порождает банды, которые наносят большой ущерб стране, грабя, разрушая, уничтожая всё в окрестности. Увы! Шартрёз де Вальбон не избежал этой участи. Фактически, такие большие и столь изолированные учреждения, как этот монастырь, по своему призванию неспособные к самозащите, были подвержены особому риску.
Религиозные поединки 16 века имели тяжелые последствия для монастыря. В 1585 году Шартрёз разграблен, разрушен и подожжен. Четырехвековые архивы превратились в дым!
Единственный "Kalendarium Cartusiae Valisbonae", объемный манускрит на 1200 страниц, составленный начиная от 1661 года, составляет резюме четырех первых столетий жизни монастыря.
Картезианский Орден снова направляет своих монахов для реставрации монастыря и его возрождения. Работы начинаются в 1593 году и через 10 лет монашеские кельи становятся снова пригодными для жилья. Энергичный настоятель монастыря, Франсуа Лоран, обеспечивает его безопасность, что позволяет монахам вернуться к нормальной жизни в монастыре.
Большой монастырь, такой, каким мы его видим сегодня, основан в этот период. Парадную дверь, в стиле эпохи Возрождения, столь величественную, увенчивает бретеш, свидетельствуя о все еще проявляющейся обеспокоенности. Реконструкция была долгой и новая церковь была построена только в 1770- 1780 гг.